Choo-Choo Charles начинается с того, что главный герой прибывает на отдаленный остров. Немногочисленные его обитатели в один голос говорят о том, что их терроризирует огромный кровожадный монстр. Решая разобраться с этим, вы отправляетесь на исследование острова. Вашим врагом оказывается жуткий поезд с лапами паука и пугающей мордой. Он очень быстро передвигается, атакует в самый неожиданный момент и может регенерировать! Кажется, что одолеть такого врага нельзя. Но для профессионального охотника на монстров вроде вас это отличный шанс доказать свой профессионализм. Передвигаться по территории острова предстоит на поезде, снабженном мощным пулеметом. Стреляйте в преследующее вас чудовище, прицеливаясь как можно лучше и стараясь нанести ему максимальный урон. Не позволяйте Чарльзу приблизиться, в противном случае он просто разорвет персонажа.
По мере исследования острова в Choo-Choo Charles, вы будете находить различные предметы, и делать массу открытий. Добывайте ресурсы при любой возможности, ведь без них усовершенствовать транспортное средство и оружие будет невозможно. Мод на меню расширит возможности геймплея, и предоставит возможность оценить весь потенциал игры. Общайтесь с другими персонажами и собирайте любую информацию о монстре, чтобы найти способ одолеть его раз и навсегда. Есть ли у Чарльза слабые места? Узнайте об этом как можно скорее! Экспериментируйте со стратегиями, каждый раз преподнося Чарльзу неприятные сюрпризы, и наблюдайте за тем, какая из них наиболее эффективна. Помните, что тварь наделена разумом, и также будет применять разные хитрости, чтобы добраться до персонажа.